Het verhaal brengt ons 30 jaar terug voor de originele Star Wars. In Episode I wordt de jonge Anakin SkyWalker, een jongen met speciale krachten, geintroduceerd, die onbewust is van het feit dat zijn reis het begin is van de tranformatie naar de slechte Darth Vader. Obiwan Kenobi, de wijze oude Jedi uit de "oude" Film is hier nog een jonge en vasthoudende leerling en Palpatine, ook wel bekend als de "Evil Emperor", is een ambitieuze Senator in de Galactic Republic. Het is nog in de tijd dat de Jedi knight de bewakers van de vrede in een turbulente Galaxy zijn en waar een jonge Koningin vecht om haar onderdanen te redden. We beginnen op de planeet Naboo, die aangevallen wordt door de Trade Federation. 2 Jedi Knight's, Qui-Gon Jinn en Obi-Wan Kenobi, proberen hier de vrede te bewaren maar helaas worden ze, als ze nog maar net aan boord van een Trade Federation Ruimteship zijn, aangevallen in opdracht van een mysterieuze Hologram. Op de vlucht geslagen voor de Battle Droids, belanden ze op Naboo waar ze al snel JarJar Binks een "Gungan" ontmoeten die hun naar zijn thuis wereld brengt waar ze misschien hulp kunnen krijgen. Na wat overtuiging door "The Force" krijgen de een onderzee vaartuig, "Bongo", en kunnen ze vertrekken naar de hoofdstad van Naboo, Theed. Na een aantal heftige ontmoetingen met een aantal prachtige en grootte zeemonsters komen ze aan in Theed. Daar is de koningin, "Queen Amidala" al gevangen genomen door de Trade Federation en het is aan de Jedi's om haar te redden en mee te nemen naar de Grote Raad op Coruscant. Maar terwijl ze ontsnappen wordt hun ship beschadigt en zijn ze genoodzaakt om op een andere planeet een nieuwe Reactor te kopen. De planeet waar ze laden heet Tantooine, bekend uit de originele Star Wars film. Hier gaan ze op zoek naar de onderdelen die ze nodig hebben en na wat omzwerfingen komen ze terecht bij Watto, een 2de hands onderdelen handelaar en een gok verslaafde. Hier maken de kennis met Anakin Skywalker die als slaaf gekocht is door Watto om alles schoon te houden. Om de onderdelen te betalen schrijven ze zich in bij een Pod-Race om het geld bij elkaar te krijgen. De Pod die ze inschrijven, is gemaakt en wordt bestuurd door Anakin die dit als enige mens kan omdat hij dingen kan zien die nog moeten gebeuren "Jedi Krachten". Qui-Qon herkend deze gave en heeft een weddenschap met Watto afgesloten om Anakin vrij te krijgen om het op te leiden als Jedi. Na het winnen van de Pod-Race die nogal wat voeten in de aarde had, repareren ze de "Nubian StarShip" en vliegen ze door naar Coruscant. Hier aangekomen wordt Anakin voorgesteld aan de Jedi Raad en Qui-Gon vraagt of hij Anakin mag opleiden, dit wordt echter geweigerd omdat ze bang zijn dat Anakin uiteindelijk de Donkere kant zal kiezen. Intussen is Amidala bezig met de verdediging van haar volk maar als dat niet helpt, besluit ze terug te keren naar Naboo. Terug op Naboo, Gaan de 2 Jedi's, Amidala en haar volk het gevecht aan met de Trade Federation, maar ook de Gungans zien het nut in om hierbij te helpen en gaan met de meest vreemde wezens ook in gevecht met de Battle Droids waarbij JarJar uiteraard weer eens de boel in de soep laat lopen. Ook Anakin help mee, al was dat niet de bedoeling, na het verstoppen in een Naboo StarFighter gaat deze de ruimte in door de automatische piloot en Anakin komt terecht in een gevecht om de BattleDroid Control Schepen te vernietigen en dankzij zijn Jedi Power vliegt hij zo goed dat dit hem ook lukt, al was het maar "Per Ongeluk". Hierdoor valt het volledige leger van de Trade Federation uit en zijn ze verslagen. Qui-Qon Jinn is echter verslagen door een Dark Jedi "Darth Maul" en overlijd. Obi-Wan Kenobi maakt het gevecht af en wint dankzij "The Force". Omdat Obi-Wan belooft heeft aan Qui-Qon dat hij Anakin zal opleiden wat er ook gebeurd, wordt dit ook door de Jedi Raad goedgekeurd en kan verhaal in Episode II worden voortgezet. De special effects zijn geweldig alleen is er 1 minpuntje, JarJar Binks. Deze is helaas door 80% van de mensen als vreselijk irritant, Better Luck Next Time George...
Tien jaar na de Slag om Naboo. Er heerst onrust in de Galactische Republiek. Steeds meer planeten hebben zich afgescheiden van de Republiek en vormen nu als de Separatisten een grote dreiging onder leiding van een voormalige Jedi, Graaf Dooku. De Republiek moet het hoofd bieden aan deze nieuwe dreiging, en daarom wordt er in de Senaat druk gediscussieerd of er een groot algemeen leger voor de Republiek komen moet. Na een mislukte poging tot een aanslag op het leven van Padmé Amidala (inmiddels senator van Naboo), krijgt ze Obi-Wan Kenobi en zijn padawan Anakin Skywalker toegewezen om haar te beschermen. Na nog een aanslag verijdeld te hebben krijgt Obi-Wan opdracht om de moordenaar op te sporen, terwijl Anakin de jonge vrouw moet blijven bewaken. Het spoor leidt naar de planeet Kamino, waar al bijna tien jaar wordt gewerkt aan een geheim kloonleger voor de republiek. De man die ervoor gekloond werd, Jango Fett doet echter nogal geheimzinnig tegen Obi-Wan en vlucht met zijn zoon Boba (die eigenlijk ook een kloon van hem is) richting de planeet Geonosis. Hier is Obi-Wan getuige hoe een enorm droidleger gebouwd wordt, en hoe Dooku met de belangrijkste en graaierigste commerciële organisaties, waaronder de Handelsfederatie, de Confederatie van Onafhankelijke Stelsels opricht, maar hij wordt gevangen genomen. Anakin en Padmé zijn intussen hevig verliefd geworden, maar kunnen hier niet mee leven, omdat het Anakin als Jedi verboden is zich aan iemand te binden. Tegelijkertijd heeft Anakin angstdromen over zijn moeder. Hij wil haar zoeken op Tatooine, en Padmé gaat mee zodat hij zijn plicht jegens haar toch niet verzaakt. Via haar nieuwe echtgenoot Cliegg Lars en diens zoon en schoondochter Owen en Beru, komt hij erachter dat ze door de Tuskens gevangen genomen is. Hij vindt haar nog vlak voor ze sterft. Bezeten door woede en haat slacht hij de hele stam Tuskens af. Als ze daarop bericht krijgen van Obi-Wan trekken ze met de droids R2-D2 en C-3PO naar Geonosis, na de Jedi-raad op de hoogte gebracht te hebben. Ze worden echter gevangen genomen, en samen met Obi-Wan ter dood veroordeeld. Gezien de toenmende dreiging worden de de bevoegdheden van Grootkanselier Palpatine uitgebreid. Deze besluit het klonenleger voor de Republiek te gebruiken tegen de Separatisten. Terwijl Yoda het klonenleger formeel gaat activeren, gaan alle beschikbare Jedi onder leiding van Mace Windu naar Geonosis om Obi-Wan, Anakin en Padmé te redden. Dit lijkt succes te hebben, maar uiteindelijk worden de Jedi en Padmé toch door het leger droids in het nauw gedreven. Totdat Yoda met de klonen ten tonele verschijnt. De separatistenleiders vluchten. Obi-Wan en Anakin trachten Dooku gevangen te nemen, maar deze verslaat hen. Yoda blijkt echter wel tegen hem opgewassen, maar met de duistere krachten van de Sith weet Dooku toch te ontkomen. Dooku, alias Darth Tyrannus, komt aan bij zijn meester Darth Sidious met het nieuws dat alles volgens plan verloopt, en tevens met speciale bouwplannen. De Klonenoorlogen zijn uitgebroken, en het melkwegstelsel zal verscheurd worden door deze enorme oorlog. Maar ondanks alles treden Anakin en Padmé op Naboo in het geheim in het huwelijk, met 3PO en R2 als getuigen!
Nadat Luke Skywalker en Leia Organa Han Solo uit de handen van de misdadiger Jabba de Hutt hebben bevrijd, gaan ze op pad om de rebellen te helpen de tweede Death Star te vernietigen. Luke gaat opnieuw de confrontatie aan met Darth Vader. Darth Vader vermoordt de keizer en wordt weer Anakin Skywalker. Hij neemt zijn masker af omdat hij met zijn eigen ogen Luke wil zien en sterft.
Het universum is veranderd na jaren van oorlog. Anakin Skywalker en Obi-Wan Kenobi zijn legendarische helden geworden in hun strijd tegen de droid-troepen van General Grievous. Anakin en Padmé Amidala, die in het geheim zijn getrouwd, zijn door de oorlog al maanden van elkaar gescheiden. Wanneer ze eindelijk worden herenigd hoort Anakin dat zijn vrouw zwanger is. Vanaf dan wordt hij geplaagd door nachtmerries over Padmés dood tijdens de geboorte van hun kind. Hij is vastberaden om dit te verhinderen. Deze angst maakt Anakin ontvankelijk voor manipulaties van Palpatine. Deze geeft aan in staat te zijn mensen voor de dood te kunnen behoeden. Anakin moet dan wel zijn leerling worden en de weg van de Dark Side te volgen. Palpatine geeft toe in werkelijkheid Darth Sidious te zijn en geeft Anakin de opdracht alle Jedi uit te roeien. Obi-Wan Kenobi moet zijn voormalige leerling trotseren in een verbazingwekkend lichtsabelduel op de vulkanische planeet Mustafar. Op het einde bevalt Padmé van een tweeling, Luke Skywalker en Leia Organa, waarna ze sterft. De twee overgebleven, machtigste Jedi (Yoda en Obi-Wan Kenobi ) besluiten dat het beter is om een tijdlang in het geheim te blijven leven. Aan het einde van de film worden Luke en Leia van elkaar gescheiden, elk naar een ander stel ouders. Leia wordt aan Bail Organa en zijn vrouw, de Koningin van Alderaan toevertrouwd en Luke wordt door Obi-Wan naar Beru en Owen Lars, zijn stiefoom en tante, gebracht. Obi-Wan zal daar blijven om over Luke te waken en om hem te trainen gedurende de tijd dat de Jedi nog steeds in ballingschap leven. Alvorens hun wegen scheiden, leert Yoda aan Obi-Wan Kenobi hoe hij, via The Force, in contact kan komen met zijn voormalige meester Qui-Gon Jinn.
Nadat Luke Skywalker twee droids vindt waarvan 1 belangrijke informatie bevat, gaat hij samen met Ben Kenobi op zoektocht naar de gevangen prinses Leia Organa. Met hulp van de vrijbuiters Han Solo en Chewbacca lukt dit. Luke en zijn nieuwe vrienden helpen Prinses Leia bij het vernietigen van de Death Star een machtig wapen van het keizerrijk. Hierbij worden ze tegengewerkt door Darth Vader die in een duel Ben Kenobi ombrengt.
Het keizerrijk zint op wraak na de vernietiging van de Death Star. Nadat zij (door middel van ruimtesondes) de rebellen te hebben gelokaliseerd op de ijsplaneet Hoth moeten de rebellen opnieuw vluchten voor het Keizerrijk. Luke Skywalker ontsnapt in een X-Wing en vliegt naar de planeet Dagobah, waar de Jedi-meester Yoda woont. Luke zoekt Yoda voor training om Jedi-meester te kunnen worden. Prinses Leia, Han Solo, Chewbacca en C-3PO ontsnappen in de beschadigde Millennium Falcon, waarmee zij naar Cloud City op de planeet Bespin vliegen. Hier zoeken ze de vroegere eigenaar van de Millenium Falcon, Lando Calrissian om de Falcon te laten repareren. Echter, een premiejager is voor het Keizerrijk achter de Falcon aangegaan en vertelt de locatie aan Darth Vader, die Solo, Chewbacca en Leia gevangen neemt. Hierbij wordt Han Solo ingevroren en aan de premiejager gegeven, aangezien Jabba de Hutt een prijs op Solo's hoofd heeft gezet. Tijdens de training op Dagobah voelt Luke dat het fout gaat met zijn vrienden en vertrekt halsoverkop naar Cloud City. Eenmaal aangekomen in deze stad wordt hij in de val gelokt door Darth Vader, die probeert om hem in te vriezen en mee te nemen naar de Keizer aangezien Luke een sterke bondgenoot van het Keizerrijk kan worden. Dit mislukt en de situatie verandert in een lichtzwaardgevecht tussen Luke en Vader. Nadat Luke in een hoek is gedreven door Vader ontwapent Vader Luke door zijn hand (en daarmee zijn lichtzwaard) eraf te hakken. Vader vraagt of Luke van zijn vader weet. Luke vertelt dat hij weet dat Vader zijn vader heeft vermoord. Vader vertelt hem echter de waarheid; Vader is Luke's vader. Na een miraculeuze ontsnapping weten Leia, Chewbacca, C3PO, Lando en Luke de resten van de rebellen op te sporen. Luke krijgt een nieuwe (robotische) hand aangemeten.